На примере переноса логов из текущей папки /logs в /var/log/cubisio. Команды требуют sudo и Cubisio установлен в /opt/cubisio/jsb-application.
$ cd /opt/cubisio/jsb-application
$ grep -r "/logs"
./kernel.conf:kernel.log.file = ${user.dir}/logs/jsbeans.log
./log4j.xml: <param name="file" value="./logs/jsbeans.log" />
./log4j.xml: <param name="file" value="./logs/scripting.log" />
./log4j.xml: <param name="file" value="./logs/auth.log" />
$ sudo mkdir -p /var/log/cubisio && sudo chown cubisio:cubisio /var/log/cubisio
kernel.log.file указав в SERVER.conf$ echo -e "\nkernel.log.file = /var/log/cubisio/jsbeans.log" >> config/SERVER.conf
$ sed -i.bak 's+\./logs+/var/log/cubisio+g' config/log4j.xml
$ sudo systemctl restart cubisio